中疾控一篇文章也称，人群血清学监测报告和主动监测报告发病率研究数据显示，高达90%~95%的百日咳感染者由于临床症状不典型、诊断技术灵敏度差异、就诊意愿等多种因素未被诊断和报告，通过主动监测获得的百日咳发病率是哨点医院报告发病率的数十倍甚至数千倍，提示现有百日咳实际疾病负担被严重低估。
有东部省份疾控人士介绍，为了应对医院上报积极性不高的问题，当地会要求哨点医院儿科及社区卫生服务中心每年至少提交一定数量的疑似病例样本，由疾控完成核酸检测。“我们觉得还是要把问题反映出来。”该人士说。
上海市疾控中心曾发文科普，解释了青少年及成年人发病率显著增高主要是四方面原因：
